气相色谱仪分析的关键是实现分离分析系统的一体化。经色谱柱分离的组分，由合适的检测器进行检测，产生的电信号由记录仪或工作站记录而得出色谱图，这一色谱图由一连串的峰组成，每一峰表示流出的一个组分，并且其数目等于组分的数目。流出的时间可以用来衡量混合物的组分，通常用某组分的流出时间或保留时间作为定性的依据，而色谱峰的高度或面积是组分浓度或含量的量度，它们是色谱定量的依据。
气相色谱仪的基本构成。气源中的载气经减压阀减压出来，流经气路箱，进入进样装置，并将注入的样品带入色谱柱，蕞后，将在柱中被分离的组分带入色谱检测器，进行鉴定和记录。系统主要由以下五个部分组成：
1.气路系统
包括气源(氮气、氦气、氢气等的钢瓶/气体发生器，气流管线)、气路控制系统，也称载气系统;载气携带试样通过色谱柱，载气在柱内形成压力梯度，压力与压力梯度是试样在柱内运行的动力。载气系统的要求是提供纯净、稳定、能被计量的载气。一般由气源钢瓶、减压阀和流量计等组成。
2.进样系统
包括进样器、各种进样口和气化室，样品由进样器注入气化室，在气化室高温作用下瞬间气化，然后在载气的携带下进入与气化室相连的色谱柱中。
3.分离系统
分离系统由色谱柱组成，它是色谱仪的核心部件，其作用是分离样品，色谱柱主要有两类:填充柱和毛细管柱。色谱柱由色谱柱管、柱内填充物等组成。柱管一般采用金属管或玻璃管，色谱柱在恒温柱箱内工作。
4.控制系统
控制系统主要的任务有:控制所有的温度及时间程序、控制各种检测器((FID, NPD和FPD)的自动点火、色谱图的保存与再处理、样品分析条件的保存、程序升温、开/关检测器、分渝不分流进样器的时间等。
5.检测和数据处理系统
样品经过色谱柱分离后，各成分按保留时间不同，顺序地随载气进入检测器，检测器把进入的组分按时间及其浓度或质量的变化，转化成易于测量的电信号，经过必要的放大传递给记录仪或工作站，蕞后得到该混和样品的色谱流出曲线及定性、定量曲线，即色谱图。
所使用的检测器主要有以下几种:
火焰离子化检测器FID 、热导检测器TCD 、电子俘获检测器ECD ,氮磷检测器NPD 、火焰光度检测器FPD 、质谱检测器MSD
